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Yaxin-1165/1168熒光動(dòng)力學(xué)測量系統數據導出與整理的方法

 更新時(shí)間:2024-04-25 點(diǎn)擊量:1026

本文檔適用于北京雅欣理儀科技有限公司生產(chǎn)的Yaxin-1165植物熒光動(dòng)力學(xué)測量系統與Yaxin-1168藻類(lèi)熒光動(dòng)力學(xué)測量系統的數據整理功能。主要包括數據傳輸、電腦端(上位機軟件)查看、導出、在EXCEL中重整理等過(guò)程。


1.數據導出


首先連接儀器與電腦的傳輸線(xiàn),其次在儀器端點(diǎn)擊【數據管理】,進(jìn)入下一界面再點(diǎn)擊【數據傳輸】。接下來(lái)有兩種模式可供用戶(hù)選擇,分別是【虛擬U盤(pán)模式】和【轉存到SD卡】,兩個(gè)模式選擇其中一個(gè)方式即可完成數據傳輸。



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1.1 數據傳輸


【虛擬U盤(pán)模式】:選擇【虛擬U盤(pán)模式】后,用數據線(xiàn)連接電腦,電腦會(huì )自動(dòng)彈出U盤(pán)。打開(kāi)U盤(pán)后,可以顯示已經(jīng)保存的文件,最新日期的文件為最后一次導出的數據,將文件復制在電腦目標文件夾下,后使用 PrjYG2021DV數據傳輸軟件查看數據。

注:在熒光儀主機的數據查看與刪除功能詳見(jiàn)說(shuō)明書(shū),該處不做介紹。


2  數據查看
2.1 PC端文件打開(kāi)操作
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圖2.1 PrjYG2021DV軟件截圖


PrjYG2021DV數據傳輸軟件為Yaxin-1165植物熒光動(dòng)力學(xué)測量系統配套的數據傳輸軟件,雙擊打開(kāi)即可進(jìn)入軟件,軟件圖標如圖2.1。



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圖2.2 數據傳輸界面


操作界面如圖2.2,包括軟件名、表格/曲線(xiàn)查看模式、參數列、給光模式、 測量類(lèi)型和文件名等信息,軟件右側第一列點(diǎn)擊【打開(kāi)文件】。



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圖2.3 文件打開(kāi)


界面彈出“打開(kāi)文件"的界面,如圖2.3,選擇需要查看的文件(文件格式“.bin"),雙擊即可在軟件中查看。


2.2 單個(gè)“OJIP測量"的表格和圖片查看


以OJIP為例,在“測量類(lèi)型"中選擇“OJIP",文件名框中則出現測量OJIP的各個(gè)文件,單擊選擇可進(jìn)行查看。在表格/曲線(xiàn)查看模式中可選擇查看類(lèi)型,表格模式如圖2.4,曲線(xiàn)模式如圖2.5。



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圖2.4 OJIP表格模式                    

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圖2.5 OJIP曲線(xiàn)模式
2.3 多個(gè)“OJIP測量"的表格數據和圖片查看


在表格模式下的OJIP模塊,按住Ctrl鍵可以多選文件名框中的文件進(jìn)行數據查看,可以用來(lái)比對多項OJIP數據,表格模式如圖2.6。在曲線(xiàn)模式下的OJIP模塊,按住 Ctrl鍵可以多選文件名框中的文件進(jìn)行曲線(xiàn)查看,比對多條OJIP曲線(xiàn)差異,曲線(xiàn)模式如圖2.7。



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圖2.6 多個(gè)OJIP表格模式                    

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圖2.7 多個(gè)OJIP曲線(xiàn)模式
2.3 多個(gè)“脈沖瞬態(tài)熒光動(dòng)力學(xué)" 的表格數據和圖片查看


在表格模式下的脈沖瞬態(tài)熒光動(dòng)力學(xué)模塊,按住 Ctrl 鍵可以多選文件名框中的文件進(jìn)行數據查看,可以用來(lái)比對多項脈沖瞬態(tài)熒光動(dòng)力學(xué)數據,表格模式如圖2.8。在曲線(xiàn)模式下的脈沖瞬態(tài)熒光動(dòng)力學(xué)模塊,按住 Ctrl 鍵可以多選文件名框中的文件進(jìn)行曲線(xiàn)查看,由于脈沖瞬態(tài)熒光動(dòng)力學(xué)數據較多,需要在操作欄中選擇一項數據進(jìn)行比對,曲線(xiàn)模式如圖2.9。


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圖2.8 多個(gè)脈沖瞬態(tài)熒光動(dòng)力學(xué)表格模式                    
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圖2.9 多個(gè)脈沖瞬態(tài)熒光動(dòng)力學(xué)曲線(xiàn)模式
3  數據導出


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圖3.1 OJIP測量模式下的表格查看界面


在表格模式下如圖3.1,選擇文件后,點(diǎn)擊表格上方的【保存表格】,可將表格中的數據(呈現在軟件表格中的數據,換言之計算值)以.csv格式保存到PC端,后續用Excel即可查看或編輯。

選中文件后,點(diǎn)擊文件名框右側的【另存為】—【保存選中的數據(表格形式)】,(如圖3.2)可將對應文件的原始數據以.csv格式保存到 PC 端,后續用Excel可以根據導出的數據作圖。

注意:【保存表格】和【另存為】這兩個(gè)途徑均可以導出csv格式的數據?!颈4姹砀瘛糠绞綄С龅氖浅尸F在軟件表格中的數據?!玖泶鏋椤繉С龅氖窃紨祿?,原始數據為隨時(shí)間推移的熒光值,如第一列是時(shí)間,第二列是熒光值?!颈4姹砀瘛堪ú糠譁y量值和全部計算值?!玖泶鏋椤繉С龅臄祿](méi)有計算值,是實(shí)測值。



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圖3.2 儲存方式


選擇【保存所有測量類(lèi)型數據】、【保存當前測量類(lèi)型數據】、【保存選中的數據】這三個(gè)選項所保存的數據均為.bin格式,該格式不能用 Excel 表格正確讀取,只能用我司配套的軟件打開(kāi)。


4  數據重整理
4.1導出數據如何手工繪制OJIP曲線(xiàn)


找到【另存為】導出的格式為.csv的文件,用EXCEL打開(kāi)該文件,選中Times(時(shí)間)及D1(熒光值)的所有數據如圖4.1所示。



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4.1 csv文件數據框選


點(diǎn)擊工具欄中的插入界面,進(jìn)入圖標欄,插入帶平滑線(xiàn)的散點(diǎn)圖,即可得到圖4.2。


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4.2 帶平滑線(xiàn)的散點(diǎn)圖


隨后對該圖片中的橫坐標進(jìn)行“對數化"處理。點(diǎn)擊帶平滑線(xiàn)散點(diǎn)圖的橫坐標數字,出現操作界面,在界面中點(diǎn)擊對數刻度,如圖4.3,即可得到OJIP曲線(xiàn),如圖4.4。



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4.3 對數化處理
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4.4 繪制OJIP曲線(xiàn)
4.2導出數據如何繪制脈沖瞬態(tài)熒光動(dòng)力學(xué)曲線(xiàn)?


脈沖瞬態(tài)熒光動(dòng)力學(xué)曲線(xiàn)俗稱(chēng)“熒光曲線(xiàn)",該曲線(xiàn)指的是在飽和脈沖與作用光相互的作用下,熒光值隨時(shí)間變化的曲線(xiàn)。如何繪制呢?

在表格模式下如圖4.5,選擇要保存的脈沖瞬態(tài)熒光動(dòng)力學(xué)數據,點(diǎn)擊右側的【另存為】,可將表格中的數據以.csv格式保存到PC端,后續用Excel即可查看或編輯,選擇存儲方式如圖4.6。



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4.5 表格模式另存為
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4.6 選擇儲存方式


找到保存的格式為.csv的文件,如圖4.7。

第一行分別為文件名,日期、時(shí)間、測量項(slowkin)及設定的參數SL=8000,n=6,AL=400。

第二行是數字,每個(gè)數字代表一個(gè)給光階段,如1代表飽和脈沖,2代表光化光,3代表再次飽和脈沖,4代表再次光化光階段。

第三行分別給出該階段所用光照的強度。OJIP(8000/1s)代表飽和脈沖的強度和時(shí)間,PulseMeas(AL400:30s)代表光化光的強度和時(shí)間。

第四行time代表時(shí)間,D1和D2代表實(shí)測的數據。



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4.7  excel打開(kāi)csv格式的脈沖瞬態(tài)熒光動(dòng)力學(xué)原始數據文件


繪制脈沖瞬態(tài)熒光動(dòng)力學(xué)曲線(xiàn)(熒光值隨時(shí)間變化的曲線(xiàn))時(shí),表格中的數據按照每個(gè)階段成一列給出。如第一個(gè)飽和脈沖為如圖4.7第1和2列,第一個(gè)光化光數據為第3-5列,以此類(lèi)推。建議選擇飽和脈沖中的最大熒光值即Fm(Fm’)和光化光的所有值,按照時(shí)間先后排序為一列作圖即可。

以六次飽和脈沖光為例,建議制作脈沖瞬態(tài)熒光動(dòng)力學(xué)曲線(xiàn)x軸時(shí)間選取數據共157個(gè),選取0.5 s、1-30s、30.5s、31-60s、60.5s、61-90s、90.5s、91-120s、120.5s、121-150s、150.5s,選擇好后排為一列作圖。

具體時(shí)間分別為500ms、1s、2 s、3 s、4 s、5 s、6 s、7 s、8 s、9 s、10 s、11 s、12 s、13 s、14 s、15 s、16 s、17 s、18 s、19 s、20 s、21 s、22 s、23 s、24 s、25 s、26 s、27 s、28 s、29 s、30 s、30.5 s、31 s、32 s、33 s、34s、35s、36 s、37 s、38 s、39 s、40 s、41 s、42 s、43 s、44 s、45 s、46 s、47 s、48 s、49 s、50 s、51 s、52 s、53 s、54 s、55 s、56 s、57 s、58 s、59 s、60 s、60.5 s、61 s、62 s、63 s、64 s、65 s、66 s、67 s、68 s、69 s、70 s、71 s、72 s、73 s、74 s、75 s、76 s、77 s、78 s、79 s、80 s、81 s、82 s、83 s、84 s、85 s、86 s、87 s、88 s、89 s、90 s、90.5 s、91 s、92 s、93 s、94 s 、95 s 、96 s 、97 s 、98 s 、99 s 、100 s、101 s 、102 s 、103 s 、104 s 、105 s、106 s、107 s、108 s、109 s、110 s、111 s、112 s、113 s、114 s、115 s、116 s、117 s、118 s、119 s、120 s、120.5 s、121 s、122 s、123 s、124 s、125 s、126 s、127 s、128 s、129 s、130 s、131 s、132 s、133 s、134 s、135 s、136 s、137 s、138 s、139 s、140 s、141 s、142 s、143 s、144 s、145 s、146 s、147 s、148 s、149 s、150 s、150.5 s。

將所選取的時(shí)間點(diǎn)作為x軸坐標數據,在導出表格中其所對應的D1數據為y軸數據,新建excel表格粘貼兩組數據,框選兩組數據,點(diǎn)擊工具欄中的插入界面,進(jìn)入圖標欄,插入帶平滑線(xiàn)的散點(diǎn)圖。


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4.8  excel完成的脈沖瞬態(tài)熒光動(dòng)力學(xué)曲線(xiàn)圖


以上內容為Yaxin-1165植物熒光動(dòng)力學(xué)測量系統與Yaxin-1168藻類(lèi)熒光動(dòng)力學(xué)測量系統的數據整理功能。尤其重點(diǎn)介紹了數據導出后如何在EXCEL中根據數據繪制圖形等過(guò)程。其他部分可以詳見(jiàn)產(chǎn)品使用指南。


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我們針對數據整理也推出了視頻版,可以在我司或公眾號跟著(zhù)視頻學(xué)習。此外,對于有需要原始數據表格模板的同學(xué),或對我司葉綠素熒光動(dòng)力學(xué)測量系統應用指南(實(shí)驗指導)感興趣的同學(xué),可以聯(lián)系我司工程師,一對一傳送。




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